Для изучения COVID-19 РНПЦ эпидемиологии и микробиологии использует облачные сервисы ActiveCloud

Компания ActiveCloud предоставила ГУ «Республиканский научно-практический центр эпидемиологии и микробиологии» вычислительные ресурсы для проведения медицинских расчетов. Сервисы облачного провайдера используются в том числе для работы в области изучения генома коронавируса.

В связи с пандемией COVID-19 резко возросло количество проводимых лабораторных исследований, проводимых РНПЦ, в то же время разработка тест-систем для диагностики заболевания основана на определении наиболее специфичных участков генома вируса. Изучение геномных последовательностей патологических агентов – сложная вычислительная задача. Обработка таких файлов занимает продолжительное время: даже после прочтения геном представляет собой строку, состоящей из четырех букв (A, C, G, T), причем его длина может достигать нескольких миллиардов символов. При этом в ДНК нет абсолютно четких «знаков препинания», которые бы указывали на начало и конец генов-предложений и других функционально значимых элементов.

Нагрузка на локальные вычислительные мощности РНПЦ ощутимо выросла. В связи с этим было решено использовать облачные сервисы для проведения наиболее ресурсоемких научных исследований, в частности генотипирования патогенов и статистической обработки информационных массивов.

Инженеры ActiveCloud предложили использовать для решения данной задачи ресурсы облачного дата-центра E-Cloud. Специалисты провайдера помогли в настройке виртуальной инфраструктуры и программного обеспечения. Использование облачных ресурсов позволило ускорить обработку больших массивов статистической информации и высвободить локальные вычислительные ресурсы научно-исследовательского центра.

Ведущий администратор сетей РНПЦ эпидемиологии и микробиологии Александр Ничипорук высоко оценил полученные результаты: «Использование облачных технологий для работы геномных ассемблеров и статистической обработки данных позволило сэкономить время и разгрузить наши локальные вычислительные ресурсы. Также, на мой взгляд, использование облачных технологий целесообразно для решения задач, которые совместно выполняют несколько исполнителей, а первую очередь для хранения общих баз данных. Облачный сервер не только предоставляет вычислительные мощности, но и обеспечивает безопасность информации».

Директор облачного провайдера ActiveCloud Павел Гончар отметил: «Мы не в первый раз оказываем помощь белорусским медицинским и исследовательским учреждениям. Мы считаем своей миссией помогать белорусской медицине всеми доступными средствами, особенно в неблагоприятный эпидемиологический период. Применение облачных технологий изменяет медицинскую и научную сферу. Огромный объем накопленных данных о пациентах, результатах исследований, научных разработках требует соответствующих ресурсов для их хранения и оперативной обработки. Безопасный облачный сервер, размещенный в Беларуси, полностью соответствует этим требованиям».